Nacido en la localidad mallorquina de Calvià, se trasladó con su familia con poco menos de dos años a Caldes de Montbui, donde empezó a tener contacto con el mundo del hockey patines. Fernández jugó a hockey en Caldes desde la escuela hasta la categoría infantil de primer año. Entonces pasó al Vic, equipo en el que jugó desde los 11 años. Tras tres años cedido al Roncato Patí Vic, Sergi Fernández llegó al Barça el verano del 2010. Desde entonces ha competido de tu a tu con Aitor Egurrola bajo los palos, además de sumar una enorme cantidad de títulos en todos estos años. La sobriedad bajo los palos le han convertido en un portero solvente y regular. Su gran test fue sustituir en la portería del Vic a Víctor Agramunt. Es uno de los mejores del mundo en la portería gracias a su capacidad de reacción y a sus reflejos inmejorables, siendo también de los pocos porteros que desvía muchas bolas con el casco.