Nascido na cidade maiorquina de Calvià, mudou-se com a sua família quando tinha pouco menos de dois anos para Caldes de Montbui, onde começou a ter contacto com o mundo do hóquei em patins. Fernández jogou hóquei em Caldes desde a escola até ao primeiro ano da categoria infantil. Integrou então a equipa do Vic, onde jogou a partir dos 11 anos de idade. Após três anos de empréstimo ao Roncato Patí Vic, Sergi Fernández juntou-se ao Barça no verão de 2010. Desde então tem competido com Aitor Egurrola entre os postes, para além de ter somado um grande número de títulos ao longo de todos estes anos. O seu sangue-frio entre os postes da baliza tornou-o num guarda-redes fiável e regular. O seu grande teste foi substituir Víctor Agramunt como guarda-redes do Vic. É um dos melhores guarda-redes do mundo graças à sua capacidade de reação e aos seus imbatíveis reflexos, sendo também um dos poucos guarda-redes que desvia inúmeras bolas com o capacete.